Fakultas Ilmu Kesehatan UIN Syarif Hidayatullah berkomitmen penuh untuk memajukan penelitian akademis berkualitas tinggi dan untuk memastikan bahwa semua kegiatan penelitian yang dilakukan oleh Sivitas Akademika, yang melibatkan partisipasi manusia dilakukan dengan cara yang sesuai dengan standar etik penelitian kesehatan yang berlaku secara internasional, dengan memperhatikan keleluasaan pribadi (privacy), martabat (dignity) subjek penelitian. Untuk saat ini Komite etik Penelitian FIKES belum menerima ajuan etik  terhadap hewan coba dan ujicoba obat. Komite Etik Penelitian Fakultas Ilmu Kesehatan (KEP-FIKES) merupakan Komite yang dibentuk melalui surat keputusan Dekan Fakultas Ilmu Kesehatan No. 49 tahun 2019 dan bertugas melakukan penilaian kelayakan etik penelitian yang dilakukan oleh Sivitas Akademika baik di dalam lingkungan maupun di luar UIN Syarif Hidayatullah.